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Page de couverture [76 kb]

Avant propos [58 kb]

Abstract [76 kb]

Résumé [60 kb]

Sommaire [920 kb]

Introduction [302 kb]		1
I. L'étude du domaine océanique profond : intérêts et imperatifs [599 kb]		3
	I.1. Intérêt biogéochimique	3
	I.2. Processus de minéralisation de la matière organique	10
	I.3.  Adaptation des microflores à la forte pression hydrostatique	12
	I.4. Manuscrit n°1 (submitted to MEPS)	19
	Effect of pressure conditions on microbial activity measurements in deep-sea water: a review
II. Matériel et Méthodes [1136 kb]		35
	II.1. Présentation des sites d'étude	35
	II.2. Moyens à la mer	41
	II.3. Abondance et biomasse bactérienne	46
	II.4. Mesure des activités ectoenzymatiques	49
	II.5. Mesure de la production de biomasse bactérienne	55
	II.6. Utilisation de composés de faibles poids moléculaires	56
	II.7. Manuscrit n°2 (submitted to Hydrobiologia)	59
	A simple and highly reproducible technique to measure the bacterial respiration of 14C-labeled compounds in seawater samples. 59
III. Activités microbiennes dans le domaine pélagique profond [1345 kb]		69
	III.1. Introduction	69
	III.2. Manuscrit n°3 (published in Deep-Sea Reasearch II, 49, 11)	71
	Biopolymer hydrolysis and bacterial production under ambient hydrostatic pressure through a 2000 m water column in the NW Mediterranean	71
	Préambule	72
	Données complémentaires	88
	III.3. Manuscrit n°4 (submitted to Aquatic Microbial Ecology)	91
	Role of deep-sea bacteria in organic matter mineralization and adaptation to hydrostatic pressure conditions in the NW Mediterranean Sea	91
	Préambule	92
	Données complémentaires	111
	III.4. Synthèse des données obtenues dans la colonne d'eau du site DYFAMED	112
	III.5. Manuscrit n°5 (submitted to Applied and Environmental Microbiology)	117
	Microbial life in the deep anoxic hypersaline basins of the Eastern Mediterranean	117
	Préambule	118
	III.6. Adaptation à la pression hydrostatique : données complémentaires et synthèse	131
IV. Activités microbiennes dans le domaine benthique profond [739 kb]		135
	IV.1. Validation des mesures d'activité microbienne à l'interface benthique	137
	IV.2. Comparaison de méthode d'estimation de l'activité microbienne dans le domaine benthique profond	147
	IV.3. Activités microbiennes dans l'épaisseur sédimentaire	152
	IV.4. Couplage pelagos-benthos	155
V. Essais complémentaires et perspectives [649 kb]		161
	V.1. Simulation de la chute de particules	161
	V.2. Activités aminopeptidasiques mesurées à l'aide de la LYA-peptides	176
	V.3. Approche moléculaire
VI. Conclusions [494 kb]		183
Références [474 kb]		191
Annexes [3800 kb]		207