Laboratoire de Microbiologie, Biogéochimie et Écologie Marines

 

Christian Tamburini

UMR 6117 - CNRS / Université de la Méditerranée
Centre d'Océanologie de Marseille
Campus de Luminy, Case 901
163 Avenue de Luminy
13288 Marseille Cedex 09 - FRANCE

Tél.: +33 4 91 82 90 53

Fax : +33 4 91 82 90 51

christian.tamburini@univmed.fr

Thème de recherche : 

Écologie microbienne des domaines océaniques  intermédiaire et profond

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Thèse

 

 

Introduction 1
I. L'étude du domaine océanique profond : intérêts et imperatifs 3
   I.1. Intérêt biogéochimique 3
   I.2. Processus de minéralisation de la matière organique 10
   I.3.  Adaptation des microflores à la forte pression hydrostatique 12
   I.4. Manuscrit n°1 19
   Effect of pressure conditions on microbial activity measurements in deep-sea water: a review
II. Matériel et Méthodes 35
   II.1. Présentation des sites d'étude 35
   II.2. Moyens à la mer 41
   II.3. Abondance et biomasse bactérienne 46
   II.4. Mesure des activités ectoenzymatiques 49
   II.5. Mesure de la production de biomasse bactérienne 55
   II.6. Utilisation de composés de faibles poids moléculaires 56
   II.7. Manuscrit n°2 59
   A simple and highly reproducible technique to measure the bacterial respiration of 14C-labeled compounds in seawater samples. 59
III. Activités microbiennes dans le domaine pélagique profond 69
   III.1. Introduction  69
   III.2. Manuscrit n°3  71
   Biopolymer hydrolysis and bacterial production under ambient hydrostatic pressure through a 2000 m water column in the NW Mediterranean  71
        Préambule  72
        Données complémentaires  88
   III.3. Manuscrit n°4  91
   Role of deep-sea bacteria in organic matter mineralization and adaptation to hydrostatic pressure conditions in the NW Mediterranean Sea  91
        Préambule  92
        Données complémentaires  111
   III.4. Synthèse des données obtenues dans la colonne d'eau du site DYFAMED  112
   III.5. Manuscrit n°4  117
   Microbial life in the deep anoxic hypersaline basins of the Eastern Mediterranean  117
        Préambule  118
   III.6. Adaptation à la pression hydrostatique : données complémentaires et synthèse  131
IV. Activités microbiennes dans le domaine benthique profond 135
   IV.1. Validation des mesures d'activité microbienne à l'interface benthique 137
   IV.2. Comparaison de méthode d'estimation de l'activité microbienne dans le domaine benthique profond 147
   IV.3. Activités microbiennes dans l'épaisseur sédimentaire 152
   IV.4. Couplage pelagos-benthos 155
V. Essais complémentaires et perspectives 161
   V.1. Simulation de la chute de particules 161
   V.2. Activités aminopeptidasiques mesurées à l'aide de la LYA-peptides 176
   V.3. Approche moléculaire
V. Conclusions 183
Références 191
Annexes 207

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Nouvelle page 1
Dernière mise à jour: Avril 2008