La série SOFCOM représente la contribution du SOC au Service National d'Observation des eaux littorales (SOMLIT) qui dépend de l'INSU. Le site d'étude choisi est un point situé au milieu de l'ouverture vers le large de la rade sud du golfe de Marseille. A ce point précis, depuis avril 1994, et tous les 15 jours (quand la météo permet de sortir en mer !) on étudie la composition des eaux entre la surface et le fond. On descend d'abord un ensemble d'appareils de mesures appelé "bathysonde" qui enregistre régulièrement au cours de la descente, la température, la salinité, la teneur en oxygène dissous et le pH ou encore la concentration en chlorophylle a. Pour chacun de ces paramètres, on réalise ainsi un profil.  Puis, à trois profondeurs (surface, fond et maximum de chl.a) de l'eau de mer est prélevée pour des analyses complémentaires en laboratoire (sels nutritifs, MES, nombre de bactéries et de cellules du phytoplancton, glucides, carbone et azote particulaires). On peut ainsi suivre l'évolution de ces caractéristiques au cours du temps, soit d'une saison à l'autre, soit d'une année à l'autre, voire à plus long terme et de comparer ces évolutions à celles qui sont mesurées lsur d'autres sites SOMLIT (Banyuls, Villefranche-sur-Mer, Arcachon, Rorscoff, Brest, Wimereux -voir page "Liens") .