PRECYM : Plate-forme Régionale de Cytométrie pour la Microbiologie
Accueil du siteDIFFUSIONProjets de recherche - Scientific projects
Brèves
Première place accordée au CNRS par le Scimago Institutions Ranking (SIR) - CNRS awarded first place at the SCImago Institutions Ranking by (SIR)
jeudi 3 janvier

Première place accordée au CNRS par le Scimago Institutions Ranking (SIR) qui produit le classement le plus complet des meilleurs institutions scientifiques mondiales.

Le CNRS figure également en 2012 parmi les 100 institutions mondiales, publiques ou privées, leaders dans le domaine de l’innovation (« Top 100 global innovators », Thomson-Reuters).

CNRS awarded first place at the SCImago Institutions Ranking by (SIR), which produces the most comprehensive ranking of the best scientific institutions worldwide.

CNRS is also in 2012 among the 100 global institutions, public and private leaders in the field of innovation ("Top 100 global innovators," Thomson-Reuters).

 
L’observation in situ à haute fréquence du phytoplancton à l’honneur dans le journal Le Monde
samedi 1er septembre

Un article paru dans le journal Le Monde du 25 août 2012 et intitulé : Des microalgues sous haute surveillance met à l’honneur l’’observation in situ à haute fréquence du phytoplancton.

Lien vers l’article

 
A new movie about the phytoplankton monitoring in the Bay of Villefranche (NW Mediterranean Sea)
jeudi 31 mai

This movie aims to describe the instruments installed on the buoy for this preliminary project. Some data are also presented. To watch the movie, click here This project is a collaborative project between MIO (Marseille), LOV and OOV (Villefranche-sur-mer), and LOG (Wimereux)

BoueeEOL

People involved :
- Gérald Grégori and Michel Denis (MIO)
- Melilotus Thyssen, Felipe Artigas (LOG),
- Jean-Michel Grisoni (OOV)
- Maria-Luiza Pedroti and Laure Mousseau (LOV)

Support of :
- the crew of the La Velelle (ship of the OOV)
- the support of the Service d’Observation (MIO)
- the Cytobuoy b.v. compagny (The Netherlands)
- Program EC2CO PNEC (MISE ; PI : G. Grégori)

 
Le COM à l’honneur dans un article du quotidien La Provence paru le 16 décembre 2011
dimanche 18 décembre

Dans le supplément du quotidien La Provence paru le 16 décembre et destiné au Forum Mondial de l’eau, le Centre d’Océanologie de Marseille* et le travail de ses chercheurs sont mis à l’honneur.

LaProvence_16122011

* : Le COM deviendra dès le 1er janvier prochain l’Institut Méditerranéen d’Océanologie (MIO).

 
Les micro-organismes livrent leurs secrets (La Provence du 18/11/2011, p10)
samedi 19 novembre

Le quotidien La Provence a publié un article dans son édition du 18 novembre 2011, en page 10 à propos de la 5th International Conference on Analysis of Microbial Cells at the Single Cell Level organisé par Gérald GREGORI, avec le soutien de l’équipe PRECYM.

ArticleLaProvence20111118
 
Articles publiés dans cette rubrique
jeudi 29 mars 2012
par gregori
Cyto-EOL Project : Amazing first data !!!
The in situ autonomous flow cytometer Cytosub (Cytobuoy) from the MIO has been installed on the EOL Buoy (OOV) for several weeks and is still operating. Sampling frequency is about 12 per day. Flow cytometry data acquisition is automatically done by the flow cytometer, and a connnection by wireless makes posssible to control the instrument, set it up if necessarey, and download the data from the laboratories. Data analysis has beeen initiated and the following figure displays the first results.
In order to characterize the local hydrology, nutrients, meteorology, seawater temperature and (...)

lire la suite de l'article
dimanche 12 février 2012
par gregori
High frequency monitoring of phytoplankton thanks to a flow cytometer installed on the EOL Buoy
The preliminary phase consisting in installing the Cytosub (Cytobuoy b.v., Netherlands) of the PRECYM platform (MIO, Marseille) on the EOL buoy of the Oceanographic Observatory of Villefranche (OOV, Villefranche-sur-mer) has been successful.
In order to get a good idea of the whole system, please visit this webpage to see a short movie : http://www.youtube.com/watch ?v=01KGH_hO-K8.
Now the cytometer, coupled to a CTD (kindly provided by the Service d’Observation du MIO, for measurement of temperature, salinity, and pressure), is automatically sampling the sea water at 1m depth, (...)

lire la suite de l'article
jeudi 2 février 2012
par gregori
Collaboration entre le MIO, le LOV et le LOG pour mieux appréhender la dynamique du phytoplancton par une approche in situ et à haute fréquence
Une collaboration entre le MIO de Marseille (Université Aix-Marseille, CNRS, IRD, Université du Sud Toulon-Var), le Laboratoire d’Océanographie de Villefranche sur Mer LOV (Université de Pierre et Marie Curie - CNRS), l’Observatoire Océanologique de Villefranche (Université Pierre et Marie Curie) et le Laboratoire d’Océanologie et Géosciences LOG de Wimereux (Université du Littoral) a permis d’installer le cytomètre en flux Cytosub de la plate-forme PRECYM du MIO sur la bouée EOL de L’OOV.
L’objectif est d’étudier la dynamique des assemblages phytoplanctoniques dans la Baie (...)

lire la suite de l'article
mercredi 28 décembre 2011
par gregori
Modifying a regular FC500 Flow Cytometer into a hyperspectral flow cytometer
PRECYM and the Purdue University Cytometry Labs modified a FC500 flow cytometer (Beckman Coulter) with multiple lasers using the iFLEX-Viper from QIoptics. A 32-channel PMT was also installed in order to collect 32 channels of fluorescence., as described in the following article Grégori G. et al., DOI : 10.1002/cyto.a.21120. In addition a multi-angle light scatter detector was mounted instead of the regular forward scatter detector. Of course, in order to collect all the parameters the electronics of the FC500 had to be supplemented with the electronics of the Gallios flow (...)

lire la suite de l'article
samedi 19 novembre 2011
par gregori
Des Trichos s’il fait trop chaud !
Le Trichodesmium est une cyanobactérie qui fixe l’azote atmosphérique, permettant ainsi au plancton et donc à l’océan de jouer son rôle de "puit de carbone".
Il participe ainsi à la régulation du climat, et à la limitation de l’effet de serre. Pour en savoir plus, voici une Vidéos en ligne - Canal IRD
Afin d’étudier le devenir de l’azote atmosphérique fixé par Trichodesmium un projet de recherche est actuellement en cours, porté par Sophie Bonnet (IRD). La plate-forme PRECYM est associée à ce projet.
Réalisation : Hubert BATAILLE
Conseillers scientifiques :
Cécile DUPOUY, (...)

lire la suite de l'article
vendredi 7 octobre 2011
par gregori
Projet EC2CO-PNEC "MISE" : Monitorage In Situ et à haute fréquence de la dynamique des assemblages phytoplanctoniques (MISE)
Les micro-organismes phytoplanctoniques sont les principaux producteurs de matière organique dans l’Océan. Ils jouent un rôle majeur dans le réseau trophique et les processus biologiques du cycle du carbone dans l’océan pélagique et côtier, domaine de recherche très important dans le contexte du changement global. La dynamique de ces assemblages pico- et nanophytoplanctoniques ainsi que leurs réactions aux variations de leur environnement sont encore peu documentées.
Plus la taille des organismes est petite et plus leur abondance est élevée, leur dynamique temporelle forte, (...)

lire la suite de l'article
vendredi 9 septembre 2011
par gregori
Hyperspectral cytometry
PRECYM et Purdue University collaborent pour développer une nouvelle génération de cytomètres capables de mieux analyser le spectre de fluorescence émis par les cellules. Très prochainement sera publié dans le journal Cytometry Part A un article présentant un dispositif qui permet de collecter 32 canaux de fluorescences :
Gregori, G., Patsekina, V., Rajwa, B., Jones, J., Ragheb, K., Holdman, C., Robinson, J.P., (2012) Hyperspectral cytometry at the single-cell level using a 32-channel photodetector. Cytometry 81A : 35-44.
Ce dispositif hyperspectral permet d’appréhender le spectre (...)

lire la suite de l'article