The following program is called Cytospec(TM) and is a general purpose flow cytometry analysis program developed at Purdue Univeristy in Paul ROBINSON’s group.
First you need the EXE file (download now) second you need the following DLL file in the same directory (download now). Please make sure that both files are in the same directory.
Tutorial : Brief instructions for running Cytospec are here (download now) and will be updated one of these (...)

lire la suite de l'article

R est un système d’analyses statistiques créé par Ross Ihaka et Robert Gentleman (Ihaka and Gentleman, 1996). Il est distribué librement sous les termes de la GNU (General Public Licence). Le développement et la distribution sont assurés par plusieurs statisticiens réunis au sein du Development Core Team (http://ww.r-project.org).
Bioconductor est un projet pour le développement et la diffusion d’outils d’analyses statistiques et graphiques en langage R (modules ou packages) . Ces outils sont destinés aux données issues d’expériences de Biologie et en particulier aux données (...)

lire la suite de l'article

Si vous souhaitez savoir comment fonctionne l’électronique d’un cytomètre en flux, et ainsi mieux appréhender comment certaines manipulations vont affecter les données, voici deux petits programmes de simulation que vous pouvez télécharger et utiliser à votre guise (et oui, ils sont gratuits !).
Le premier, "Flow Cytometer Simulator", développé par Bruce Bagwell est disponible chez Verity Software House
This application provides a simulation of a working flow cytometer. It was developed to illustrate issues with color compensation, but also provides insight into many other attributes of (...)

lire la suite de l'article

WinMDI est un logiciel d’analyse de données de cytométrie en flux gratuit développé par J. Trotter (USA). Ce logiciel est très performant, et la qualité des graphiques est excellente lorsqu’ils sont copiés dans des logiciels de traitement de texte, ou autre.
Voici donc un petit tutorial anti-stress qui vous permettra d’apprendre très rapidement et facilement à utiliser WinMDI.

lire la suite de l'article

LDATAPP dumps FCS listmode or histogram data into ASCII text files. It has a simple interface to select input files and output paths. It requires a 32 bit Microsoft Windows operating system.
You can either download it from the PUCL Website : http://www.cyto.purdue.edu/flowcyt/software/ldatapp.htm or click on the document below.
Authors : Valery Patsekin, Steve Kelley, Gerald Gregori, J. Paul Robinson

lire la suite de l'article