PRECYM : Plate-forme Régionale de Cytométrie pour la Microbiologie
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Brèves
Atelier INSERM - Advances in cytometry : new applications and insights in basic and clinical research
mardi 12 mars

1-3 octobre 2013 ◘ 1 st -3 rd October 2013 Bordeaux, France Aims :

Recently, great technological improvements have been performed in multiparameter flow cytometry (MFC) to study complex biological systems. However, the difficulty of implementing MFC is a real barrier limiting its broad use. Similarly, knowledge is often lacking, in advanced analytical tools and methods needed to handle the mass of information generated by MFC. An emerging innovating technology, the multiparameter mass cytometry (MMC) allows the simultaneous analysis of more than 40 parameters. This new technology (also referred to as CyTOF) faces similar challenges in analysis and data visualization as MFC. Therefore, the formation into the laboratories is crucial to control all aspects of multiparametric approaches that will be addressed during this workshop. To fulfill these goals, MFC and MMC technologies will be introduced by experts of each experimental field and illustrated using concrete examples of applications in clinical research. These presentations will be completed by an introduction to current software solutions in order to analyze huge datasets generated by these two approaches. Finally, emerging technologies will be presented, mainly in the field of image cytometry. Audience All biological scientists, engineers, medical doctors, post-doctoral fellows and students who are interested in the application of advanced cytometry techniques in their respective experimental fields and are eager to increase the number of parameters studied simultaneously. A basic knowledge in conventional flow cytometry (4-6 parameters) is required. Lectures will be given in English.

Avec la participation de / with the participation of :
- Mario ROEDERER (Bethesda, USA),
- Francis LACOMBE (Bordeaux, France),
- J. Paul ROBINSON (Indiana, USA),
- Juan FLORES-MONTERO (Salamanca, Spain),
- Ryan R. BRINKMAN (British Columbia, Canada),
- Rodolphe THIEBAUT (Bordeaux, France),
- Andrea COSSARIZZA (Modena, Italy),
- Scott TANNER (Toronto, Canada),
- Jonathan IRISH (Nashville, USA),
- Samuel GRANJEAUD (Marseille, France),
- Garry NOLAN (Stanford, USA),
- Attila TARNOK (Leipzig, Germany),
- Philippe BOUSSO (Paris, France),
- Michael GERNER (Bethesda, USA),
- Marie FOLLO (Freiburg, Germany),
- William TELFORD (Bethesda, USA).



— Date limite d’inscription : 21 juin 2013  Registration deadline : June 21 st 2013
— Renseignements et inscriptions / Information and registration
— Inserm / Ateliers de formation / 101 rue de Tolbiac / 75654 Paris Cedex 13
— Tel. +33 (0) 1 44 23 62 04 or 62 03 / Fax +33 (0) 1 44 23 62 93 / ateliers@inserm.fr

 
Sur le Web : Atelier INSERM
Première place accordée au CNRS par le Scimago Institutions Ranking (SIR) - CNRS awarded first place at the SCImago Institutions Ranking by (SIR)
jeudi 3 janvier

Première place accordée au CNRS par le Scimago Institutions Ranking (SIR) qui produit le classement le plus complet des meilleurs institutions scientifiques mondiales.

Le CNRS figure également en 2012 parmi les 100 institutions mondiales, publiques ou privées, leaders dans le domaine de l’innovation (« Top 100 global innovators », Thomson-Reuters).

CNRS awarded first place at the SCImago Institutions Ranking by (SIR), which produces the most comprehensive ranking of the best scientific institutions worldwide.

CNRS is also in 2012 among the 100 global institutions, public and private leaders in the field of innovation ("Top 100 global innovators," Thomson-Reuters).

 
An excellent tutorial in flow cytometry : with many animations
lundi 29 octobre

This a very nice tutorial describing the verious aspects of a flow cytometer thanks to sseveral animations.

Click here

 
L’observation in situ à haute fréquence du phytoplancton à l’honneur dans le journal Le Monde
samedi 1er septembre

Un article paru dans le journal Le Monde du 25 août 2012 et intitulé : Des microalgues sous haute surveillance met à l’honneur l’’observation in situ à haute fréquence du phytoplancton.

Lien vers l’article

 
A new movie about the phytoplankton monitoring in the Bay of Villefranche (NW Mediterranean Sea)
jeudi 31 mai

This movie aims to describe the instruments installed on the buoy for this preliminary project. Some data are also presented. To watch the movie, click here This project is a collaborative project between MIO (Marseille), LOV and OOV (Villefranche-sur-mer), and LOG (Wimereux)

BoueeEOL

People involved :
- Gérald Grégori and Michel Denis (MIO)
- Melilotus Thyssen, Felipe Artigas (LOG),
- Jean-Michel Grisoni (OOV)
- Maria-Luiza Pedroti and Laure Mousseau (LOV)

Support of :
- the crew of the La Velelle (ship of the OOV)
- the support of the Service d’Observation (MIO)
- the Cytobuoy b.v. compagny (The Netherlands)
- Program EC2CO PNEC (MISE ; PI : G. Grégori)

 
Sur le Web
Plateforme Régionale de Cytométrie pour la Microbiologie PRECYM
Site de la Plateforme Régionale de Cytométrie pour la Microbiologie PRECYM
lundi 15 décembre 2008
Bienvenue sur le site Internet de la Plate-forme de cytométrie PRECYM

La Plate-forme REgionale de CYtométrie pour la Microbiologie PRECYM a été créée en 2005 avec le soutien d’un consortium de 6 unités de recherche liées à l’Université de la Méditerranée, au CNRS et à l’IRD pour répondre à une forte demande de la part des laboratoires dans le domaine de la cytométrie en flux.

PRECYM est spécialisée dans l’analyse à l’échelle individuelle des micro-organismes (dans une gamme de taille de l’ordre de 0,05 à 1000µm) : identification, tri, dénombrements, physiologie, viabilité, activités. Elle met à disposition des équipes du MIO et des autres unités/instituts de recherche, du domaine public ou privé son savoir faire et ses instruments. Son but est d’offrir aux microbiologistes la possibilité d’utiliser de nouvelles approches en garantissant une exploitation technique, économique et scientifique optimale des instruments. Ainsi ils n’ont pas à fournir eux-mêmes l’effort d’investissement en équipement et en savoir faire.

PRECYM a trois missions : i) Expertise, ii) Conseil et accompagnement, et iii) Formation-Cours

La plate-forme intervient dans :
- L’aide au développement et/ou l’amélioration d’un protocole expérimental,
- L’aide à l’analyse et à l’interprétation des données de cytométrie et des résultats,
- La formation à l’utilisation des instruments de la plate-forme,
- L’expertise pour les laboratoires privés aussi bien pour l’analyse que pour le tri d’échantillons.

Tout naturellement, la gamme des utilisations en microbiologie est très large et concerne différents domaines (environnement, santé, biotechnologie, etc...).

(Mentions légales)


La plate-forme PRECYM est co-financée par l’Union Européenne. L’Europe s’engage en PACA, avec les Fonds Européens de développement régional.


English version Chinese version Tunisie

 
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dimanche 3 février 2013
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Novo D., Grégori G., Rajwa B. (2013). Generalized unmixing model for multispectral flow cytometry utilizing non-square compensation matrices. Cytometry Part A 83A : 508-520
M. Girault, H. Arakawa, A. Barani, H. J. Ceccaldi, F. Hashihama, S. Kinouchi, G. Gregori (2013) Distribution of ultraphytoplankton in the western part of the North Pacific subtropical gyre during a strong La Niña condition : relations with the hydrological conditionsBiogeosciences Discussions 03/2013 ; 10(3):5701-5748.
Malkassian A., Mante C., Thyssen M., Nérini D., Garcia F., Grégori G. (2013) Suivi in situ et à haute (...)

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jeudi 31 janvier 2013
par gregori
Precym involved in the European Project INCOMMET with the INSTM of Tunis (Tunisia)
PRECYM is involved in the INCOMMET project. INCOMMET is a response to the Call FP7-INCO-2011-6 but is also relevant to the EU objectives of the Environment Work Programme. The INCOMMET project, coordinated by the National Institute of Marine Sciences and Technologies (INSTM), the major public research institution in Tunisia in the field of oceanography and marine environments, and also involving the Aix-Marseille Université (AMU, France) and the Zoological Station of Naples (SZN, Italy) aims at increasing research excellence and visibility of INSTM, and fostering its participation into (...)

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jeudi 31 janvier 2013
par gregori
FORMATION CYTOMETRIE EN FLUX du 28 au 30 janvier 2013 – INSTM- La Goulette (Tunisie)
Du 28 au 30 janvier 2013, la plate-forme PRECYM a organisé une formation théorique et pratique en cytométrie en flux dans le cadre du projet Européen INCOMMET piloté par l’INSTM de Tunis, avec le soutien de l’Université d’Aix-Marseille (AMU).
Les intervenants ont été :
Gérald GREGORI (Institut Méditerranéen d’Océanologie, Marseille)
Michel DENIS (Institut Méditerranéen d’Océanologie, Marseille)
Melilotus THYSSEN* (Institut Méditerranéen d’Océanologie, Marseille)
Kevin RAGOT (PARTEC France)
Au programme de ces trois journées de formation :
Principes généraux de la (...)

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samedi 1er décembre 2012
par gregori
2012 : Formation permanente en cytométrie en flux (INSERM-CNRS)
Cette année encore la platerofme PRECYM a contribué à une action de formation permanente en cytométrie en flux, formation organisée par l’INSERM et le CNRS.
Session : INTER REGION - Introduction à la cytométrie en flux : de la bactérie aux cellules eucaryotes - théorie et pratique - Marseille
Région : Provence / Alpes-Côtes d’Azur / Corse
Domaine : Techniques scientifiques
Sous-domaine : Imagerie
Action : Imagerie cellulaire
Objectifs :
Connaître les limites et avantages de la cytométrie en flux
Acquérir les bases théoriques et pratiques de la cytométrie en flux
Publics et (...)

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mercredi 7 novembre 2012
par gregori
The VIII Irish Cytometry Society Conference
Galway, Ireland, 6-7 November, 2012
Flow cytometry continues to be one of the most important techniques available to life scientists, both in research and clinical settings. As applications rapidly expand it is essential for users to be aware of these developments, and how they can use the methods to maximize their work output.
The Irish Cytometry Society (ICyS) was set up in 2005 to provide a forum for all who work in cytometry (flow cytometry and allied technologies) in Ireland. With members involved in fields as varied as marine biology, microbiology, immunology, drug development, (...)

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