Laboratoire de Microbiologie Géochimie et Ecologie marine

Les micro-organismes sont les principaux producteurs et minéralisateurs de la matière organique dans l’océan. Les travaux qui sont développés par cette équipe visent à une meilleure compréhension du rôle de ces derniers dans les processus de transformation et de minéralisation de la matière organique au sein des réseaux trophiques. L’enjeu de nos recherches dans le cadre de ce plan quadriennal est donc d’établir des liens entre la dynamique des successions des communautés microbiennes et la dynamique fonctionnelle de ces mêmes communautés, en relation avec les flux biogéochimiques et les conditions environnementales.

En raison de la diversité spécifique de ces communautés et de leurs versatilités métaboliques, leur étude et la caractérisation de leurs activités nécessite une approche intégrée depuis le niveau cellulaire jusqu’à l’écosystème dans son ensemble, ainsi qu’une diversité d’approches associant biologie moléculaire, traceurs isotopiques, cytométrie en flux, mesures in situ automatisées.

Ce travail a été réalisé dans une variété d’écosystèmes marins : la colonne d’eau (eau et particules en suspension des milieux méso- et bathypélagique), les sédiments et les tapis microbiens.

1. De la zone euphotique au système bathypélagique - Activités et structure des communautés bactériennes

Interactions hétérotrophes-autotrophes dans le fonctionnement de la pompe biologique océanique-Dynamique du réseau trophique microbien et bilans métaboliques

Structure et activités des procaryotes en milieu méso et bathypélagique

2. Zones soumises à des gradients d’oxygène : allant jusqu’à l’anaérobiose - Activités et structure des communautés bactériennes associées

Devenir d’une contamination pétrolière dans des sédiments bioturbés – Hétérogénéïté spatiale

Processus intervenant dans le cycle de l’azote

Processus de production de méthane ou méthanogénèse