Philippe CUNY

Fonction actuelle [current position] : MC1, Ecologie Microbienne

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THEMES DE RECHERCHE [AREAS OF RESEARCH]
  • Etude de la dynamique (structure et "fonction hydrocarbonoclaste") des communautés bactériennes dans les écosystèmes sédimentaires bioturbés soumis à des apports chroniques ou massifs d'hydrocarbures (HC). Le devenir des HC dans les milieux meso- et bathypélagiques et dans les sédiments profonds est à ce jour très peu connu. On sait notamment très peu de choses sur l’effet de la pression hydrostatique sur la biodisponibilité (modes de transferts), les voies et les cinétiques de biodégradation de ces composés par les bactéries. Par conséquent, un effort important sera réalisé pour évaluer la capacité des bactéries hydrocarbonoclastes à résister à de fortes pressions hydrostatiques et à dégrader les hydrocarbures dans les environnements profonds. Ce travaille est conduit dans le cadre du projet ANR « POTES » (« Pressure effect On marine prokaryoTES » - Projet n°JC05_55952.
  • Technique : Techniques générales de la microbiologie (bactéries et algues unicellulaires) ; Techniques de biologie moléculaire (extraction - purification de l’ADN sédimentaire, amplification génique, électrophorèse, RISA, DGGE, clonage) ; Chromatographie Liquide Haute Performance ; Chromatographie en phase Gazeuse (DIF) ; Chromatographie en phase Gazeuse/Spectrométrie de masse (Impact électronique, Ionisation chimique) ; Procédures analytiques utilisées en géochimie organique moléculaire (extraction/séparation/dérivatisation/quantification de composés organiques).

    • DIPLOMES
  • Doctorat en Sciences de l’Environnement Marin (spécialité Océanologie) année: 1997

    FONCTIONS ANTERIEURES [PREVIOUS POSITIONS]
  • LOB UMR CNRS 6535 1998 ATER
  • (non renseignée...)

    • PUBLICATIONS

    [469] Pischedda, L.,Poggiale, J.C.,Cuny, P.,Gilbert, F. (2008) Imaging Oxygen Distribution in Marine Sediments. The Importance of Bioturbation and Sediment Heterogeneity. Actabiotheoretica, 56, 123-135
    [373] Miralles, G.,Grossi, V.,Acquaviva, M.,Duran, R.,Bertrand, J.C.,Cuny, P. (2007) Alkane biodegradation and dynamics of phylogenetic subgroups of sulfate reducing bacteria in an anoxic coastal marine sediment artificially contaminated with oil. Chemosphere, 68: 1327-1334
    [374] Miralles, G.,Nérini, D.,Manté, C.,Acquaviva, M.,Doumenq, P.,Michotey, V.,Nazaret, S.,Bertrand, J.C.,Cuny, P. (2007) Effects of spilled oil on bacterial communities of Mediterranean coastal anoxic sediments chronically subjected to oil hydrocarbon contamination. Microbial Ecology 54(4):646-61
    [379] Cuny, P.,Miralles, G.,Cornet-barthaux, V.,Acquaviva, M.,Stora, G.,Grossi, V.,Gilbert, F., (2007) Influence of bioturbation by the polychaete Nereis diversicolor on the structure of bacterial communities in oil contaminated coastal sediments. Marine Pollution Bulletin, 54: 452-459.
    [321] Grossi, V.,Cuny, P.,Caradec, S.,Nerini, D.,Pancost, R.,Gilbert, F., (2006) Impact of feeding by Arenicola marina (L.) and ageing of faecal material on fatty acid distribution and bacterial community structure in marine sediments: an experimental approach.. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 336: 54-64.
    [326] Cuny, P.,Gilewicz, M.,Acquaviva, M., (2004) Phenanthrene degradation, emulsification and surface tension activities of a Pseudomonas putida strain isolated from a coastal oil contaminated microbial mat. OPHELIA, 58 : 283-287
    [93] Cuny, P.,Marty, J.C.,Chiaverini, J.,Vescovali, I.,Raphel, D.,Rontani, J.F., (2002) One-year seasonal survey of the chlorophyll photodegradation process in the Northwestern Mediterranean sea. Deep Sea Reasearch II 49: 1987-2005
    [79] Rontani, J.F.,Perrote, S.,Cuny, P., (2000) Can a high chlorophyllase activity bias the use of phytyldiol versus phytol ratio (CPPI) for the monitoring of chlorophyll photooxidation in seawater?. Organic Geochemistry 31: 91-99
    [75] Cuny, P.,Rontani, J.F., (1999) On the widespread occurrence of 3-methylidene-7,11,15-trimethylhexadecan-1,2-diol in the marine environment: a specific isoprenoid marker of chlorophyll photodegradation. Marine Chemistry 65: 155-165
    [76] Cuny, P.,Romano, J.C.,Beker, B.,Rontani, J.F., (1999) Comparison of the photodegradation rates of chlorophyll chlorin ring and phytol side-chain in phytodetritus: is the phytyldiol versus phytol ratio (CPPI) a new biogeochemical index?. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 237: 271-290
    [115] Cuny, P.,Gilewicz, M.,Faucet, J.,Acquaviva, M.,Bertrand, J.C., (1999) Enhanced Biodegradation of phenanthrene by a marine bacterium in presence of a synthetic surfactant. Lett. Appl. Microbiol., 29 : 242-245.

     

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