Cette étude sera réalisée en collaboration avec l'équipe de l'Unité de Physiologie Microbienne de l'Institut Pasteur dans le cadre de la convention signée entre l'Institut Pasteur et l'IRD  

Objectifs spécifiques

F    Déterminer le potentiel toxique des efflorescences de cyanobactéries, notamment de Trichodesmium

F    Développer les outils moléculaires pour la détection, l'identification et la quantification des cyanobactéries toxiques.  

Stratégie

Le premier élément de la stratégie consistera à rechercher une éventuelle association entre le développement de "blooms" de cyanobactéries et notamment de Trichodesmium à la côte et des intoxications liées à la consommation de produits de la mer récoltés dans la zone de ces "blooms". Cette recherche se fera en collaboration avec les organismes de santé présents dans les chantiers et le réseau ECOTOX développé par la COI.

Le second volet de la stratégie consistera en la recherche du potentiel toxique des cyanobactéries par des méthodes génétique, enzymatique, immunologique, ou physico-chimique selon le type de toxine suspecté et la sensibilité de détection requise (Pour en savoir plus).

L'Unité de Physiologie Microbienne à l'Institut Pasteur

Depuis plus de 25 ans, la thématique de l'Unité de Physiologie Microbienne, dirigée depuis 1988 par N. Tandeau de Marsac, est la biologie des cyanobactéries. Les deux thèmes de recherche qui y sont développés concernent la biodiversité et les potentialités biotechnologiques des cyanobactéries dulcicoles et marines ainsi que leurs mécanismes moléculaires d'adaptation à l'environnement (dont la toxicité). Elle possède une collection de plus de 700 souches pures provenant de divers écosystèmes (PCC, "Pasteur Culture Collection"). PCC 9511 est la première souche de Prochlorococcus marinus qui ait été obtenue à l'état pur après la découverte de ce groupe en 1988. L'unité a développé une base qui comprend plus de 350 séquences d'ARN 16S, une autre qui rassemble les tailles des amplifiats ITS ("Intergenic Transcribed Spacer") de plus de 250 souches et enfin une base qui contient les données disponibles à ce jour sur l'ensemble des souches de la collection. Une base de données bibliographiques avec plus de 7000 références est également disponible.