La stratégie qui a été retenue utilise différentes approches (écologique, biogéochimique, génétique, écotoxicologique et de modélisation) et repose sur les choix suivants:

F      Réaliser un suivi régulier et fréquent des facteurs du milieu et des populations de cyanobactéries, impliquant donc des observations sur le domaine côtier (lagonaire). Certaines de ces observations pourront être utilisées ensuite pour prévoir les phénomènes sporadiques (efflorescences) qui se déroulent au large.

F      Mettre au point une stratégie d'échantillonnage et des mesures de biomasse qui soient en accord avec les données de taux de fixation et de productivité des Trichodesmium (Pigments, nombre de colonies, carbone, poids sec etc.). En effet, un travail de recherche reste encore à effectuer pour choisir les méthodes d’échantillonnage les plus appropriées en raison de leur taille très supérieure à celle du phytoplancton généralement observé dans les eaux oligotrophes, de leur mode de répartition sous-dispersée et de la nécessité de considérer leur distribution verticale dans la couche euphotique.