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Cette
action s'inscrit pour l'ur099, dans le sous projet DIAPAZON.
C'est une opération financée en partie par PROOF |
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L'utilisation
de ces données est soumise aux conditions:
Nous
vous invitons à respecter ces conditions d'utilisation afin de
faciliter les échanges de données au sein de la communauté
scientifique.
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Méthodologie:
Production bactérienne
(incorporation de TdR)
Les
mesures de production bactérienne n’ont été réalisées qu’à
partir de la Diapalis 4. La production bactérienne a été estimée
à partir de la méthode d'incorporation de Thymidine tritiée
[Methyl-3H] (TdR).
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Les échantillons
(15-30ml) sont inoculés avec 15nM de TdR (concentration finale)
et incubés 90 minutes sur le pont du bateau dans des
incubateurs alimentés avec l'eau de surface. En fin
d'incubation, les échantillons sont formolés (37% tamponné)
et filtrés sur filtres 0.2µm (Nuclepore) préalablement
imbibés de thymidine non radioactive. En fin de filtration,
le vide est rompu et les macromolécules sont précipitées
avec de l’acide TriChloroAcétique (TCA 5% w/v) pendant 15
minutes à 4°C. Le vide est ensuite rétabli et les membranes
sont rincées trois fois avec 5ml de TCA 5%. La quantité de
radioactivité présente sur le filtre et donc incorporée par
les bactéries est mesurée à l’aide d’un compteur à
scintillation. Des témoins sont réalisés régulièrement à
chaque station avec des échantillons formolés avant ajout de
TdR et incubés en parallèle. Les détails de la méthode
sont décrits dans Torréton et Dufour (1996). |
L'effet
de la température est corrigé à partir des températures in situ
données par la CTD selon l'équation d'arrhénius avec un Q10
= 1.63 (Jacquet, pers. comm.).
Les
données (moyenne sur 2 ou 3 sous-échantillons) sont exprimées en
pMTdR h-1 ou en valeurs intégrées en nmolTdR/h/m2. Pour
convertir ces valeurs en µgC l-1 h-1 on peut
utiliser le facteur de conversion de 12.4 fgC cell-1 (Fukuda
et al., 1998) et de 2.1018
cell mol-1 TdR (Ducklow and Carlson, 1992)
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Production
bactérienne
(Assimilation
thymidine tritiée)
Les
stations sont les traits de la sonde, c'est-à-dire une unité
espace (latitude/longitude) / temps. |
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Lagon Ouinné |
xls |
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Baie du Santal |
xls |
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Chenal des Loyauté |
xls |
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DIAPALIS 7 |
xls |
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DIAPALIS 9 |
xls |
Références
Ducklow
H. W. and Carlson C.A.
(1992) Oceanic bacterial production. Adv.
Microb. Ecol., 12, 113-181.
Fukuda, R., H. Ogawa, T. Nagata and I. Koike (1998). "Direct
determination of carbon and nitrogen contents of natural bacterial
assemblages in marine environments." Appl.
and Environn. Microbiol., 64,
3352-3358.
Jacquet,
S. (2001). Importance comparée des biomasses et productions bactérienne
et primaire planctonique et leurs relations avec les variables
physico-chimiques dans le lagon Sud-Ouest de Nouvelle-Calédonie.
Rapport de DEA, Université de Pierre et Marie Curie Paris VI, 32
pp.
Torréton J.-P. and Dufour P. (1996) Bacterioplankton prodution
determination by DNA synthesis, protein synthesis, and frequency
of dividing cells in Tuamotu atoll lagoons and surrounding ocean. Microb.
Ecol., 32, 185-202.
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