Ishikawa Yoshio

Marc

Cyanobactéries benthiques

Cinq types de cyanobactéries benthiques ont été répertoriés :

F Type 1 : Des cyanobactéries de couleur marron (sans doute Lymbya), épiphytes d’algues de très petite taille colonisant les substrats meubles.

F Type 2 : Des cyanobactéries vertes, fixées par un byssus sur un substrat dur, posé sur le sable, formant des chandelles pouvant atteindre 20 cm.

F Type 3 : Des cyanobactéries de couleur verte pâle, accrochées à des substrats durs posés sur les fonds sédimentaires.

F Type 4 : Des cyanobactéries marron, formant des croûtes de 1 mm d’épaisseur, résistantes, agglomérant du sable et colonisant les substrats durs morts.

F Type 5 : Des cyanobactéries (?) mélangées au gazon de couleur marron qui colonisent les Acropores morts et parfois vivants.

Méthodologie

Les organismes étaient prélevés à la pince à filtre et introduits dans trois flacons de culture de 70 ml remplis avec l’eau du site. Le flacon était fermé avec un bouchon transparent en silicone en évitant les bulles d’air.  

Au retour au laboratoire, 0,1 ml de ¹⁵N₂ gazeux (1 litre 99,1%, contenu dans une bouteille de 0,5 litre) était injecté dans le flacon à travers le bouchon en silicone.

Les flacons étaient incubés pendant 24 heures à l’aquarium de St Gilles avec un cycle de 12 h lumière, 12 heures obscurité. A la fin des incubations, le contenu des flacons était filtré sur GFF 25 mm, préalablement grillé. Les filtres étaient conservés après séchage dans des petits flacons en verre (préalablement grillés) jusqu’à leur analyse au spectromètre de masse au LOB à Marseille.

Pour tester cette méthodologie, des biomasses croissantes de cyanobactéries vertes ont été incubées en triplicat : faible biomasse, moyenne et forte

Biomasse phytoplanctonique

L’abondance du phytoplancton a été déterminée dans le lagon aux lieux dits Trou d’eau, Club Med et Hermitage. Trois stations ont été prospectées à Trou d’eau et Club Med et une à l’Hermitage. Un prélèvement de l’autre côté de la barrière récifale a aussi été réalisé.

La chlorophylle a été dosée sur les 3 classes de taille > 10 µm, > 3 µm et > 0.4 µm (GF/F). Deux échantillons de 1.5 ml ont été fixés au glutaraldehyde (8 µl) et conservés dans l’azote liquide pour comptage du picoplancton en cytométrie en flux. Un échantillon formolé à 4 % a été conservé à l’obscurité pour comptage du microphytoplancton.

Essai méthodologique pour filtrations

Pour utiliser les batteries de filtration successives en 47 mm, il faudrait installer en fin de chaîne un filtre isopore (sans rétention d’eau) de 0,4 µm.

Di 30 nov 2003

Arrivée des équipes IRD et japonaise. Accueil par Patrick Frouin du laboratoire ECOMAR et Jean François Daniel directeur de l’IRD à la Réunion. Il fournit à l’équipe de l’UR099 un véhicule de l’IRD, et rendez-vous est pris pour le lendemain avec toutes les équipes, au laboratoire de St Gilles.

Lu 1 dec 2003

Réunion au laboratoire de St Gilles sur le port. Chacun se présente et annonce ses projets de recherche sur le nouveau site :

•  L’équipe ECOMAR étudiera les flux de nutriments à l’interface eau-sédiments à l’aide de deux dômes transparents et un obscur posés sur le fond sédimentaire.

• L’équipe japonaises dirigée par M. Yoshimi Suzuki étudiera la matière organique particulaire (POM) et dissoute (DOM) dans les eaux, dans des bouteilles d’incubation en présence de cyanobactéries et dans les dômes. Elle étudiera aussi le flux de Ca à l’intérieur des dômes. Des prélèvements seront réalisés pour Béatriz Casareto pour la taxonomie du microphytoplancton et l’abondance des bactéries hétérotrophes.

• L’équipe japonaise dirigée par M. Tamotsu Oomori étudiera les caractéristiques physiques et chimiques (courantométrie, salinité, énergie lumineuse, alcalinité, oxygène dissous, pCO2) des eaux du lagon pour estimer production et la calcification des communautés coralliennes.

• L’équipe dirigée par M. Yuzo Shioi étudiera la composition du phytoplancton par l’analyse des pigments photosynthétiques et des caroténoïdes par HPLC.

• M. Kimy Fukami étudiera les bactéries toxiques responsables potentiels du blanchissement des coraux en prélevant des morceaux de coraux de différentes espèces.

• Enfin l’équipe de l’IRD étudiera la biomasse des différentes classes de taille du  phytoplancton par la chlorophylle. Elle étudiera le picoplancton par cytométrie en flux et la composition et le taux de fixation d’azote des communautés de cyanobactéries benthiques.

Le matériel est déballé et préparé pour le lendemain.

Ma 2 dec 2003

Journée de travail sur le site dit « Trou d’eau », présenté comme le moins perturbé par les influences anthropiques des trois sites de travail de l’équipe ECOMAR. Le temps est au beau, l’eau est calme et claire. Les fonds ne dépassent guère 1,2 m. Plusieurs opérations sont mis en oeuvre :

• L’équipe ECOMAR installe pour 48h 3 dômes équipés de capteurs d’oxygène dissous, de pH et de température. Les prélèvements pour analyse des sels nutritifs et d’alcalinité sont effectués toutes les 4h

• L’équipe IRD prélève l’eau de 3 stations sur un transect allant du rivage près des dômes posés par ECOMAR vers la barrière récifale. Elle repère les différents types de cyanobactéries benthiques, les prélève pour identification ultérieure et place les organismes dans des flacons à incubation de 65ml bouchés par un bouchon en silicone. Ces flacons seront incubés pendant 24h en présence de ¹⁵N₂ à l’aquarium de St Gilles. Elle effectue enfin une radiale de 50 m à partir du dôme vers le large sur une largeur de 1m, afin d’évaluer la densité des cyanobactéries les plus abondantes.

• Les équipes japonaises installent sur le site leurs mini sondes multiparamètres et leurs courantomètres. Ils parcourent le lagon avec des sondes transportables.

Me 3 dec 2003

Suite des travaux sur le site « Trou d’eau » avec encore une excellente météo (eau claire). Arrêt vers 16h des expériences de dôme. Départ de l’équipe ECOMAR.

Je 4 dec 2003

Forte houle et fort courant latéral. Pas de prélèvements.

Ve 5 dec 2003

Houle moins forte, courant côtier. Les Japonais récupèrent le matériel installé sur le site Trou d’eau. L’équipe IRD effectue ses prélèvements sur un sol marin déserté par les cyanobactéries. Retour à StDenis pour une réunion à l’Université avec l’équipe d’ECOMAR et son directeur H. Bruggemann. Conférence de Y Suzuki. Départ des Japonais.

Sa 6 dec 2003

Houle encore moins forte. Beau temps. L’’équipe IRD effectue des prélèvements océaniques le matin et des prélèvements dans le site perturbé Club Med, sur 3 stations, l’après-midi.

Lu 8 dec 2003 

Journée méthodologique. D’une part concernant les mesures de chlorophylle : travail sur le choix des filtres et la comparaison entre filtrations directes et filtrations successives. D’autre part, réalisation d’incubations pour la fixation d’azote en présence de quantités croissantes d’organismes.

Ma 9 dec 2003

Mise en forme des données acquises et rédaction du rapport de mission.

Me 10 dec 2003

Nettoyage et rangement des matériels et laboratoire

Je 11 dec 2003