D’élaborer et d’animer des programmes de recherche interdisciplinaire sur les cyanobactéries d’eaux douces et marines. Ces programmes peuvent être fondamentaux ou appliqués. 

De faciliter la coordination des travaux conduits en son sein (identification des moyens disponibles, des compétences …).

De structurer l’offre de recherche au regard des sources potentielles de financement (Ministères, Agences de l’Eau, Traiteurs et Distributeurs d’eau…).

D’aider à la formulation de projets dans le cadre des programmes de recherche européens.

De constituer un interlocuteur aux gestionnaires et utilisateurs des plans d’eau connaissant des problèmes avec les cyanobactéries.

De conseiller comme expert les organismes en charge de la surveillance, pour l’établissement d’un plan national de surveillance des cyanobactéries s’appuyant sur un réseau de laboratoires d’analyse.

D’assurer une valorisation des résultats et connaissances acquises accessibles au plus grand nombre (réunions, formation, publications spécifiques, expertises, site Internet…).

De promouvoir une animation scientifique nationale et internationale (organisation de colloques par exemple).