La connaissance de la composition de la matière organique particulaire du phytoplancton en général et des cyanobactéries en particulier permet d'évaluer le degré de limitation des organismes par le N et P et d’obtenir une indication de la valeur de ces organismes pour le réseau trophique. Les transferts trophiques seront abordés dans le cadre des relations entre compartiments biotiques, tandis que l’étude des transferts mécaniques vers le fond et l’interface eau-sédiment permettra d’évaluer les flux entrecompartiments pélagiques et benthiques.
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