Dans les milieux peu profonds, les processus physiques à petite échelle jouent un rôle déterminant dans les apports nutritifs qui permettent le développement des peuplements algaux, par l’intermédiaire de la morphologie des sites, de la courantologie locale et des facteurs météorologiques forçant. Des études courantologiques fines à des échelles de l’ordre du décimètre et de la minute donneront de l’information sur les courants induits par les vents et, le cas échéant, les marées. Les temps de résidence et les vitesses d'échange fourniront les données nécessaires à une modélisation numérique de la circulation. Une bonne connaissance des champs de courant, et, le cas échéant, de température et de salinité, est un préalable à une meilleure caractérisation de l’environnement des différents sites et des échelles de temps qui accompagnent les principaux processus permettant leur modélisation.
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