La dynamique du réseau microbien dépend de celle des bactéries hétérotrophes, dont un des facteurs de contrôle est la disponibilité en nutriments. Différentes voies d’enrichissement sont possibles, allochtones ou autochtones, dont celles liées aux interactions entre bactéries et algues. Par leur nature, les exudats phytoplanctoniques jouent un rôle majeur sur la croissance des bactéries et donc sur la dynamique du réseau microbien, les bactéries hétérotrophes étant par exemple des compétiteurs actifs pour le phosphore. En conditions nutritives limitantes, le bactérioplancton semble avoir des réponses d’assimilation plus rapides que les organismes photosynthétiques supérieurs, réponses qui seront étudiées dans des systèmes soumis à différents types et rythmes d’enrichissement.