Les participants au projet d’UR ont l’expérience des thématiques liées à la productivité, à la qualité et aux usages des milieux aquatiques, qu’ils soient estuariens, lagonaires, lagunaires ou lacustres. Cette expérience se traduit par une production scientifique importante (on en trouvera la liste pour la période 2001 – 2004 en Annexe 1). Pour les membres IRD et leurs partenaires Nord et Sud, le projet de nouvelle Unité s’articule avec les programmes auxquels ils ont participé jusqu’à présent :

dans l’UR 098 « Déterminisme et conséquences des efflorescences algales en milieux aquatiques
peu profonds »,, sur les petits barrages de Côte d’Ivoire, les lacs de Sélingué et de Manantali au Mali, de Guiers et de Dakar Bango au Sénégal et l’estuaire du fleuve Sénégal. Ces travaux combinant approches environnementales et expérimentales font suite aux programmes « Petits Barrages » en Côte d’Ivoire et « Açudes » au Brésil, « Environnement Lagunaire » en Côte d’Ivoire et « GIRHEx » au Mali.
dans l’UR 099 « Cyanobactéries marines : déterminisme de leur prédominance et rôle trophique dans les milieux tropicaux », sur les écosystèmes coralliens de Nouvelle Calédonie et de l’Océan Indien, sur la diazotrophie dans l'Océan Pacifique (programme « DIAPAZON ») et la productivité et la qualité des eaux du delta du Mékong au Vietnam et des lagunes à Madagascar. Ces travaux font suite aux programmes « CYEL » et « TYPATOLL », menés sur les lagons d’atoll du Pacifique.