La taxinomie des espèces de cyanobactéries permettra d’identifier clairement les populations cibles, en particulier en cas d’efflorescence. L’approche taxinomique des communautés phytoplanctoniques permettra de suivre les successions et de définir des groupes fonctionnels. Dans le cas de taxons potentiellement toxiques, la diversité génétique des populations sera étudiée. L’importance prise par les cyanobactéries au sein du phytoplancton et leur éventuelle dominance sont liées à leurs particularités écophysiologiques, dont leur équipement pigmentaire qui permet la photosynthèse à des intensités lumineuses très basses, leur résistance aux fortes irradiances et à la photo-inhibition et la possibilité d’assimiler le diazote dissous d’origine atmosphérique. Aussi, les caractéristiques spécifiques (taux de croissance, stratégies nutritionnelles, cycles biologiques, formes de résistance, exudats et toxines) des souches identifiées au sein des écosystèmes étudiés seront abordées dans les différents chantiers de l’Unité.
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