Sur demande des autorités malgaches, l'Institut Halieutique des Sciences Marines (IHSM) a entrepris, en partenariat avec l'IRD (UR CYROCO) d'étudier la productivité des lagunes de Fort Dauphin (S-E Madagascar). Le souhait clairement affiché est de développer des pêcheries et d'initier l'aquaculture. De ce fait les recherches sur l'environnement côtier de la région Sud de Madagascar s'inscrivent dans une réelle perspective de développement en partenariat.
L'intérêt scientifique réside dans le fait que nous avons un cas d'école d'étude des écosystèmes lagunaires côtiers en passe de subir des perturbations anthropiques. Le site d'étude est complet. Il présente trois lagunes contiguës de taille moyenne de 5 à 10 km2. La lagune Est, Anratoloharano est quasi fermée, les échanges se font par intermittence avec la lagune centrale d'Andranasy. Cette seconde lagune possède une liaison permanente avec la lagune d'Andriambe. Cette dernière est la lagune d'échange. Elle reçoit en amont les eaux du fleuve Efaho et elle possède en aval une passe la reliant à la mer. Une pêche traditionnelle est pratiquée dans chacune d'elle, et les espèces capturées sont les mêmes mais les quantités péchées différent sensiblement suivant les lieux.
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