• Les bactéries

• Les protistes

• Le micro et le mésozooplancton

• Le réseau trophique

Les protistes

Généralités

Les protistes constituent un règne dans la classification de Whittaker de 1969 qui en compte cinq (procaryotes, protistes, végétaux, champignons, animaux). En fonction de leur mode de nutrition, ils étaient autrefois répartis entre protozoaires appartenant au règne animal et protophytes liés au règne végétal. Cependant, certaines formes surtout parmi les flagellés, peuvent être autotrophes ou hétérotrophes. De plus, un groupe, les myxomycètes est revendiqué par les mycologues qui étudient leurs curieuses fructifications aériennes pédonculées de quelques millimètres. Mais leur cycle comporte une longue phase amiboïde qui les place parmi les protistes et leur vaut la dénomination de mycétozoaires. D'autre part parmi les protophytes, la limite avec les formes coloniales d'algues est indistincte et donc le règne protiste chevauche le règne végétal. Les protistes ont en commun l'organisation unicellulaire. Ils vivent en général dans le milieu aquatique ou sont parasites. Leur nombre serait de plus de 30 000 espèces. Leur systématique varie beaucoup selon les manuels consultés. Ils comportent plusieurs embranchements assez différenciés. 

Pour en savoir plus sur les protistes.

Dans les lagons d’atolls

On distingue les ciliés et les flagellés. 

• Les ciliés appartiennent principalement à 3 ordres : les Choretotrichida (longueur 70 – 136 µm), les Oligotrichida (50 – 132 µm) et les Pleurostomatida (55 – 136 µm). 

• Les dinoflagellés sont représentés par 3 ordres : les Peridiniales (30 – 83 µm), les Gymnodiniales (18 µm), et les Prorocentrales (40 µm). Les 2 espèces largement dominantes sont des flagellés hétérotrophes Protoperidium sp. et Gymnodinium sp.  

Biomasse dans les atolls de Tikehau et Takapoto  

Les abondances et biomasses des protistes dans les 2 lagons étudiés apparaissent dans le tableau suivant :

On observe dans le lagon de Tikehau des variations temporelles importantes de la biomasse des protistes.

Observations à Tikehau en octobre 94
Abondance en dinoflagellés   individus / ml	Abondance en ciliés  individus / ml

Abondance des flagellés dans 10 atolls des Tuamotu 

Sur les 10 lagons prospectés lors du programme TYPATOLL, nous avons réalisé des comptages de flagellés autotrophes et flagellés hétérotrophes lors des missions de novembre 95 et mars 96, soit à deux saisons différentes.

Les flagellés hétérotrophes sont généralement plus abondants que les autotrophes. Ils sont particulièrement abondants aux 2 saisons dans les lagons de Reka-Reka et Tepoto sud, en mars 96 à Haraiki et Tairao.
En discriminant par saison et par type d'eau (eaux des lagons d'atoll et eaux océaniques avoisinantes), on dénombre en moyenne, en excluant l'atoll très ouvert de Tekokota:
En novembre 95 : dans les lagons d'atoll 2 400 flagellés autotrophes / ml , 4 300 hétérotrophes /ml dans les eaux océaniques 1 000 flagellés autotrophes / ml , 1 400 hétérotrophes /ml	En mars 96 : dans les lagons d'atoll 2 500 flagellés autotrophes / ml , 6 500 hétérotrophes /ml dans les eaux océaniques  330 flagellés autotrophes / ml , 2 200 hétérotrophes /ml

Bibliographie utilisée :

Gonzalez J.M., Torréton J.-P., Dufour P., Charpy L. (1998) Temporal and spatial dynamics of the pelagic microbial food web in atoll lagoon. Aquatic Microbial Ecology 16: 53-64

Loret P, Le Gall S, Dupuy C, Blanchot J, Pastoureaud A, Delesalle B, Caisey X, Jonquieres G (2000). Heterotrophic protists as a trophic link between picocyanobacteria and the pearl yoster Pinctada margaritifera in the Takapoto lagoon (Tuiaomotu Archipelago, French Polynesia). Aquatic Microbial Ecology 22: 215-226

Sakka A, Legendre L, Gosselin M,Delesalle B (2000). Structure of the oligotrophic planktonic food web under low grazing of heterotrophic bacteria: Takapoto Atoll, French Polynesia. Marine Ecology-Progress Series 197: 1-17